Презентация на тему "Поиск литературы и составление библиографии"

Содержание

• 
  Слайд 1
  

  Поиск литературы и составление библиографии Степанов Герман Олегович, germanstep@gmail.com В PubMed’е 19 млн публикаций

• 
  Слайд 2
  

  Но это было два года назад. Сегодня уже более 22 миллионов публикаций можно найти в PubMedе

• 
  Слайд 3
  
• 
  Слайд 4
  

  На что мы обратим особое внимание http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ (www.pubmed.gov)

• 
  Слайд 5
  

  При сравнении обычной библиотечной карточки… На бумажной карточке есть: Автор [au] Название [ti] Год [dp] Страницы[pg] http://www.kinder.mksat.net/slon/card02.gif Но все эти поля есть и в электронной карточке в PubMed’е

• 
  Слайд 6
  

  … с электронной карточкой На электронной карточке есть: PMID- 16408039 TI - Cytochrome c acts as a cardiolipinoxygenase required for release of proapoptotic factors. PG - 223-32 AB - Programmed death (apoptosis) is turned on in damaged or unwanted cells to secure their clean and safe self-elimination. The initial apoptotic events are coordinated in mitochondria, whereby several proapoptotic factors, including cytochrome c, are released into the cytosol to trigger caspase cascades. AD - Center for Free Radical and Antioxidant Health and Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, Pennsylvania 15260, USA. vkagan@eoh.pitt.edu FAU - Kagan, Valerian E AU - Kagan VE FAU - Tyurin, Vladimir A LA - eng GR - 1R01 HL70755/HL/NHLBI NIH HHS/United States TA - Nat ChemBiol JT - Nature chemical biology JID - 101231976 RN - 0 (Cardiolipins) MH - Animals MH - Apoptosis/*physiology EDAT- 2006/01/13 09:00 MHDA- 2006/02/04 09:00 CRDT- 2006/01/13 09:00 PHST- 2005/03/23 [received] PHST- 2005/07/19 [accepted] PHST- 2005/08/14 [aheadofprint] AID - nchembio727 [pii] AID - 10.1038/nchembio727 [doi] PST - ppublish SO - Nat Chem Biol. 2005 Sep;1(4):223-32. Epub 2005 Aug 14.

• 
  Слайд 7
  

  PubMed не отпустит Вас без результата Обычное окно поиска

• 
  Слайд 8
  

  Но как же правильно составляется поисковый запрос в PubMed’е

• 
  Слайд 9
  

  Схема составления поискового запроса 1. При составлении поискового предложения поисковые термины (т.е. слова) разделяются одним пробелом Перксидазная активность - peroxidase activity 2. Поисковые термины обязательно связываются между собой Булевым оператором (AND OR NOT (только заглавные буквы) Возможная ошибка – если Вы забыли проставить оператор, то скорее всего система автоматически проставит AND Перксидазная активность - peroxidaseAND activity 3. Для того что бы адресовать термин в интересующее Вас поле (авторы, название, год и др) Вам необходимо сразу после термина (без пробела) в квадратных скобках указать соответствующий оператор Перксидазная активность - peroxidase[ti]AND activity[ti] Важно заметить! На наших занятиях (и в Вашей контрольной работе) формулировка …«посвященные» … чему-либо будет означать, что это «чему-либо» нужно искать в поле НАЗВАНИЕ (Title). Т.е. [ti]

• 
  Слайд 10
  

  Схема составления поискового запроса 1. При составлении поискового предложения поисковые термины (т.е. слова) разделяются одним пробелом Перксидазная активность - peroxidase activity 2. Поисковые термины обязательно связываются между собой Булевым оператором (AND OR NOT (только заглавные буквы) Возможная ошибка – если Вы забыли проставить оператор, то скорее всего система автоматически проставит AND Перксидазная активность - peroxidaseAND activity 3. Для того что бы адресовать термин в интересующее Вас поле (авторы, название, год и др) Вам необходимо сразу после термина (без пробела) в квадратных скобках указать соответствующий оператор Перксидазная активность - peroxidase[ti]AND activity[ti]

• 
  Слайд 11
  
• 
  Слайд 12
  

  Если «раскрыть» ссылку

• 
  Слайд 13
  

  Обращения в определенные поля поиска (то что пишеться в квадратных скобках после термина поиска) AU- фамилии и инициалы авторов osipov[au] (1025 публикаций) osipova[au] (226 публикаций) osipovan[au] (85 публикаций) Возможная ошибка: иногда в международных журналах указывается только один инициал и в поиске osipova[au] интересующая Вас работа будет, а в osipovan[au] нет. Общепринятое правило – чем конкретнее поиск, тем выше вероятность отсечь нужную информацию, а при снижении конкретности появляется много ненужных публикаций. Многие фамилии содержат буквы не поддающиеся транслитерации на английский (одной буквой): Ж- zh, Ш- sh И- I, y Щ- shch Й- I Ы- y Ий- ii, y Ь- ‘, je, i Х- khЭ- e Ц- tsЮ- iu, y, yu, ju Ч- chЯ- ia, ya Владимиров Юрий Андреевич Iu Iua Y Ya Yu yua

• 
  Слайд 14
  

  Обращения в определенные поля поиска FAU- фамилии и инициалы авторов osipova[au] (226 публикаций) osipovanatoly[fau] (11 публикаций) AD- служебный адрес первого автора и e-mail (иногда), очень важное поле – необходимое Вам когда Вы будете спрашивать особенности проведения исследований. Важная заметка для любого поиска – во всех поисковых системах есть стоп-слова, слова игнорируемые поиском PubMed как не несущие смысловой нагрузки

• 
  Слайд 15
  

  Обращения в определенные поля поиска SO- FEBS Lett. 2009 Jan 5;583(1):97-100. Epub 2008 Dec 4 Хотя можно указывать только название журнала в аббревиатуре MedLine[ta] (что это такое), или отдельно год[dp], или том[vi], или первую страницу[pg]. DP- когда проводиться поиск и нужно выбрать интервал дат публикаций то можно задать 2000:2009[dp], а если проводиться поиск по конкретной дате, то 2009[dp]. АбривеатруаMedLine FEBS Lett. – FEBS Letters Title: Bulletin of experimental biology and medicine ISSN: 0007-4888 (Print) 1573-8221 (Electronic) Title Abbreviation: Bull Exp Biol Med ISO Abbreviation: Bull. Exp. Biol. Med. Publication Start Year: 1956 Current Indexing Status: Currently indexed for MEDLINE.

• 
  Слайд 16
  

  Обращения в определенные поля поиска IP- выпуск EDAT- Дата ввода документа в базу (может отличаться от выпуска бумажной версии) 2009[edat] 2006:2009[edat] IS – ISSN EIS- Electronic ISSN TI- одно из самых главных полей поиска – когда перед Вами поставлено задание искать работы посвященные чему-либо, это что-либо нужно искать в частности и в поле[ti] AB- поле абстракт (не доступно для поиска) PT- Тип публикации (журнальная, обзор, клинические испытания, а всего их 50) review[pt].

• 
  Слайд 17
  

  Обращения в определенные поля поиска MH- Медицинские предметные рубрики (слова за которыми закреплен статус понятий). Каждому понятию соответствует только один термин – остальные синонимы лишь ссылаются на него. (Результат запроса cancer[mh]более 2000000)

• 
  Слайд 18
  

  На что мы обратим особое внимание http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ (www.pubmed.gov)

• 
  Слайд 19
  
• 
  Слайд 20
  

  Как выглядит окон Медицинские предметные рубрики при запросе cancer

• 
  Слайд 21
  

  Обращения в определенные поля поиска MH- Медицинские предметные рубрики (слова за которыми закреплен статус понятий). Каждому понятию соответствует только один термин – остальные синонимы лишь ссылаются на него. (Результат запроса cancer[mh]более 2000000)

• 
  Слайд 22
  

  Обращения в определенные поля поиска NM-Имя вещества (ethanol[nm] более 60000 работ) Название основных соединений которые применялись при исследованиях данной работы. RN- для поиска работ с использованием соединений можно использовать Регистрационные номера этих веществ (ethanol[rn] более 60000 работ) (EC 1.11.1.6[rn] каталаза) PMID – Уникальный идентификационный номер публикации в PubMed 19059242[pmid] 1AU-первый автор, обычно это автор выполнивший наибольшее количество исследований в данной работеosipov a[1au] (69) LASTAU-последний автор, обычно это авторosipov a[lastau] (49) – руководитель работы

• 
  Слайд 23
  

  Как пишутся поисковые термины (т.е. слова по которым проводиться поиск) Правило 1:Почти у всех слов может быть разное окончание (следует использовать астерик «звездочку» вместо окончания)(hypertension) Правило 2: Фраза – если Вы задали в поиск словосочетание или определенную последовательность слов - Вы должны ограничить их кавычками. ("swine flu") Возможная ошибка – «внутри» кавычек нельзя использовать астерик Правило 3: Если Вы хотите задать сочетание поисковых терминов – Вы должны использовать: а. Булевы операторы (AND OR NOT) б. Круглые скобки (для выставления приоритетов выполнения логических операций) 2+2*2=6, (2+2)*2=8 Возможные ошибки: Существует последовательность выполнения операторов (начало) […] → AND → OR → NOT (окончание) Главная цель при использовании астерика – это выделить смысловой корень поискового термина

• 
  Слайд 24
  

  Как пишутся поисковые термины (т.е. слова по которым проводиться поиск) AANDB AORB ANOTB

• 
  Слайд 25
  

  Как пишутся поисковые термины (т.е. слова по которым проводиться поиск) Токсическое действие аспирина на пациентов страдающих астмой за интервал времени с 2002 по 2009 год aspirin toxity poisoning asthma animals 2002:2009 aspirin[nm] AND toxity OR poisoning AND asthma[ti] NOT animals[mh] AND 2002:2009[dp] (((aspirin[nm] AND (toxity OR poisoning)) AND asthma[ti]) NOT animals[mh]) AND 2002:2009[dp]

• 
  Слайд 26
  

  Найдите работы посвященные: Когда Вы слышите – найдите публикации посвященные чему либо – это значит нужнообращать термин поиска в поле название (title) Агрегация тромбоцитов Ультразвуковая диагностика Найдите работы с Вашей фамилией (не указывая инициалов) #3 за последний год #3 за последние 3 года