Презентация на тему "СИНДРОМ - ?"

Содержание

• 
  Слайд 1
  

  И.В. Канивец ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ

• 
  Слайд 2

  СИНДРОМ - ?

  ВПС Особенности фенотипа Аномалии соединительной ткани Задержка развития Особенности характера и поведения Задержка роста Эндокринные нарушения

• 
  Слайд 3
  

  Неонатальная гипотония Нормальный или ускоренный рост Тяжелая задержка развития Нормальная окружность головы Множественные МАР

• 
  Слайд 4
  

  1 970,0млн USD 469,2 млн USD

• 
  Слайд 5
  

  1 970,0млн USD 469,2 млн USD dup 17p11.2 del 1p36 del 9q34.3 del 3q29 del 22q13.3 dup7q11.23 del 15q24 dup 22q11.2

• 
  Слайд 6

  ХРОМОСОМНАЯ ПАТОЛОГИЯОПРЕДЕЛЕНИЕ

  Хромосомная патология – любое нарушение числа и/или структуры хромосом

• 
  Слайд 7

  ХРОМОСОМНАЯ ПАТОЛОГИЯКЛИНИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ

  числовые и структурные аномалии хромосом (за исключением сбалансированных) патогенны характеризуются мультисистемным поражением являются причиной задержки развития/умственной отсталости часто является причиной потери беременности многие микроделеционные синдромы не имеют четкого фенотипа и часто остаются недиагностированными не могут быть вылечены могут возникать повторно при следующих беременностях являются показанием для консультации врача-генетика

• 
  Слайд 8
  

  ЭВОЛЮЦИЯ ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ Термин «кариотип» впервые появился в Pubmed Был предложен термин «хромосома» 48 хромосом у человека Разработаны методы окраски хромосом Установлено количество хромосом у человека FISH BAC array CGH Oligo array CGH иSNP хромосомный микроматричный анализ 1947 1888 1923 1970s 1956 1986 2002 2004 ACMG & ISCA рекомендуют заменить кариотипирование хромосомным микроматричным анализом 2010 2012 Хромосомный микроматричный анализ зарегистрирован в России как медицинский тест

• 
  Слайд 9

  НА ПУТИ К МОЛЕКУЛЯРНОМУ КАРИОТИПИРОВАНИЮ

• 
  Слайд 10
  
• 
  Слайд 11

  КАК ВЫЯВИТЬ ВСЕ КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ CNV?

• 
  Слайд 12
  

  Хромосомный микроматричный анализ – молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров, покрывающих определенный набор генов или весь геном, без необходимости культивирования клеток Синонимы: молекулярное кариотипирование, сравнительная геномная гибридизация на чипах, молекулярно-цитогенетическое исследование ОПРЕДЕЛЕНИЕ

• 
  Слайд 13
  

  ИСТОРИЯ Первый прототип микроматицы на микроскопном стекле 1993 Создание микроматрицы с общей последовательностью проб >1 млн. нуклеотидов 1995 Первая опубликованная научная работа с использованием микроматриц (Shena et al.) 1996 Промышленный выпуск микроматриц (Affymetrix) 1997 Полногеномный экспрессионный анализ S. cerevisiae (De Risi et al.) 1999 Молекулярная классификация опухоли и использованием микроматриц (Goluet al.) 2000 Молекулярный фенотип опухли (Pat Brown et Al.) 2003 Производители микроматриц Affymrtrix, Illumina, Agilent, Nimblegen (Roche) и мн. др. 2004 Полногеномный анализ на одной микроматрице (Affymetrix) 2005 Первая микроматрица одобренная FDA (Amplichip, Roche) 2008Широкое использование разных типов микроматриц – SNP, CNV, Expression, ChIP, Tilling и пр. 2011 >100,000 исследований с использованием микроматрицв молекулярной цитогенетике. Выявление причин ВПРи ЗПМР в 20-25% случаев.

• 
  Слайд 14

  СРАВНИТЕЛЬНАЯ ГЕНОМНАЯ ГИБРИДИЗАЦИЯ

• 
  Слайд 15

  ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ

• 
  Слайд 16
  

  Normal 2N AA:(0.5+0.5)=+1 AB: 0.5-0.5 = 0 BB: 0-(0.5+0.5)=-1 Loss 1N A:0.5-0 =+0.5 B:0-0.5=-0.5 Mosaic loss Mosaic gain Loss of heterozigosity AA AB BB A B Gain 3N AAA:(0.5+0.5+0.5)=+1.5 AAB: (0.5-0.5 )-0.5 = +0,5 ABB: 0.5-(0.5+0.5)=-0.5 BBB: 0-(0.5+0.5+0,5)=-1.5 AAA AAB ABB BBB Each point represent a single SNP interrogated by A or B alleles probes and assigned an arbitrary fluorescence uni of haploid locus (single allele) =0,5 A-B=? АНАЛИЗ СИГНАЛА ОТ SNP

• 
  Слайд 17

  CGH или ХМА?

• 
  Слайд 18
  

  Распределение проб на микроматрицах разной плотности Микроматрица 400К – 90% Микроматрица 2,67М – 99,6% Клиническая достоверность

• 
  Слайд 19
  

  МИКРОМАТРИЦЫ ВЫСОКОЙ, СРЕДНЕЙ И НИЗКОЙ ПЛОТНОСТИ 2,7 млн 750тыс 180тыс

• 
  Слайд 20

  ТЕОРЕТИЧЕСКОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ РАЗРЕШАЮЩЕЙ СПОСОБНОСТИ МИКРОМАТРИЦ

  Размер определяемых микроделеций и микродупликаций зависит от параметров маркерных сигналов на микроматрице 1. Волнистость (Waviness SD) глобальная мера распределения зондов, которая нечувствительна к вариациям распределения на коротких расстояниях и сфокусирована на больших расстояниях 2. Различие в интенсивности сигнала между двумя соседними маркерами (MAPD - Median of the Absolute values of all Pairwise Differences) При Волнистости

• 
  Слайд 21

  ОПРЕДЕЛЕНИЕ РАЗРЕШАЮЩЕЙ СПОСОБНОСТИ МИКРОМАТРИЦЫ В ХОДЕ ИССЛЕДОВАНИЙ

  Отсутствие маркеров в области интрона Область отсутствия гетерозиготности Гетерозиготная делеция 31 экзона гена EP300, размер 1297 п.н.

• 
  Слайд 22
  

  ПациентЛ. Клиническая картина: Задержка развития, фенотип синдрома Рубинштейна-Тейби Молекулярный кариотип:arr[hg19]16p13.3(3828749_3833104)x1 Размер4355 пн. Обнаружена делеция двух экзонов гена CREBBP, ассоциированного с синдромом Рубинштейна-Тейби

• 
  Слайд 23
  

  КАКОЕ РАЗРЕШЕНИЕ ВЫБРАТЬ?

• 
  Слайд 24
  

  DNA extraction Digestion Ligation PCR amplification QC control 1 Purification Fragmentation Quantitation QC control 2 Labelling Hybridization Washing and staining Scanning Data processing Data analysis Report 1 2 3 4 ЭТАПЫ ХРОМОСОМНОГО МИКРОМАТРИЧНОГО АНАЛИЗА 46 пипетирований, 10 стадий и 2,5 дня от образца до результата

• 
  Слайд 25

  ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ ХМА

• 
  Слайд 26

  ВАРИАЦИИ ЧИСЛА КОПИЙ ДНК (CNV)

  Вариация числа копий (CNV) – это изменение числа копий определенного сегмента ДНК размером, по крайней мере, 1000 п.н., по сравнению с репрезентативным референсным геномом. Термин «CNV» не подразумевает исходно обязательной клинической значимости, поэтому CNVsклассифицируются на патогенные, непатогенныеи CNVsс неизвестной значимостью.

• 
  Слайд 27
  

  СРЕДНЕЕ КОЛИЧЕСТВО CNV У ЧЕЛОВЕКА Частота (%)

• 
  Слайд 28
  

  ОПРЕДЕЛЕНИЕ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТИ (КАУЗАТИВНОСТИ) CNVs Базы данных OMIM,ISCA, DECIPHER, GeneReviews, литературные данные -PubMed

• 
  Слайд 29
  

  Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций? Содержит ли CNV область, делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома? Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов? Каков общий генный контент или размер CNV? Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo? Является ли CNV наследуемой? ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

• 
  Слайд 30
  

  Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций? Содержит ли CNV область, делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома? Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов? Каков общий генный контент или размер CNV? Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo? Является ли CNV наследуемой? ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

• 
  Слайд 31

  ПОПУЛЯЦИОННЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ CNVs

  http://dgv.tcag.ca/dgv/app/home

• 
  Слайд 32
  

  Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций? Содержит ли CNV область, делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома? Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов? Каков общий генный контент или размер CNV? Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo? Является ли CNV наследуемой? ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

• 
  Слайд 33
  

  Koolen-De Vries syndrome (OMIM 610443)Chromosome 17q21.31 deletion syndrome

  Обнаружены микроделеции участков длинного плеча 17 хромосомы в регионе 17q21.31, размер 564 kb и 537 kb соответственно. Подобные микроделеции являются причиной Koolen-De Vries syndrome (OMIM 610443)

• 
  Слайд 34
  

  Рекомендуется проводить дифференциальную диагностику с 5 синдромами: с. Прадера-Вилли, с. Ангельмана, Велокардиофациальным с., с. Мартина-Белл, Кардиофациокутанеальным с.

• 
  Слайд 35
  

  Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций? Содержит ли CNV область, делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома? Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов? Каков общий генный контент или размер CNV? Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo? Является ли CNV наследуемой? ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

• 
  Слайд 36

  МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА СИНДРОМА СОТОСА

• 
  Слайд 37
  
• 
  Слайд 38

  ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ДИАГНОСТИКА СИНДРОМА СОТОСА

  Синдром Вивера Синдром Беквита-Видемана Синдром Банаян-Райли-Рувалькаба Дупликации 4p Мозаичная трисомия 20p11.2-р12.1 Синдром делеции 22q13.3

• 
  Слайд 39
  

  Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций? Содержит ли CNV область, делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома? Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов? Каков общий генный контент или размер CNV? Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo? Является ли CNV наследуемой? ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

• 
  Слайд 40

  ГЕННЫЙ КОНТЕНТ И РАЗМЕР CNV

  Количество генов Размер CNV

• 
  Слайд 41
  

  Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций? Содержит ли CNV область, делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома? Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов? Каков общий генный контент или размер CNV? Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo? Является ли CNV наследуемой? ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

• 
  Слайд 42

  CNV: НАСЛЕДУЕМАЯ ИЛИ DE NOVO?

  ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ ПОЗВОЛЯЕТ ВЫЯВЛЯТЬ МИКРОДЕЛЕЦИИ… Пациент К., женщина 32 г. Беременность 21 неделя. ВПС: тетрада Фалло у плода. Материал: амниотическая жидкость Обнаружена микроделеция 3p26.3. Размер: 1,4 Mb

• 
  Слайд 43
  
• 
  Слайд 44

  КЛАССИФИКАЦИЯ CNVs

  CNVs Патогенные Непатогенные Вариации с неизвестной клинической значимостью LPAT LBEN Нет подклассификации LPAT – вероятно патогенные LBEN – вероятно непатогенные

• 
  Слайд 45

  ПАТОГЕННЫЕ CNVs

  Описаны в базах OMIM и ORPHANET как делеционный/дупликационный синдром Описаны в 2 и более рецензируемых публикациях и/или базе DECIPHER у пациентов со сходными клиническими проявлениями

• 
  Слайд 46

  НЕПАТОГЕННЫЕ CNVs

  CNV была описана во многих рецензируемых публикациях или курируемых базах данных, как непатогенная, особенно если ее генетическая природа хорошо описана и/или если она является распространённым полиморфизмом

• 
  Слайд 47

  CNVs С НЕИЗВЕСТНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТЬЮ, ВЕРОЯТНО ПАТОГЕННАЯ

  CNV описана в единственной рецензируемой публикации, но с чёткими границами и фенотипом, соответствующими наблюдаемым у пациента. CNVописана как вероятно патогенная врецензируемых публикациях и базах данных у пациентов со сходными клиническими проявлениями В регионе CNV имеется ген с известной функцией, нарушение которой может привести к клиническим проявлениям, сходным с наблюдаемыми у пациента.

• 
  Слайд 48

  CNVs С НЕИЗВЕСТНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТЬЮ, ВЕРОЯТНО НЕПАТОГЕННАЯ

  В районе CNV отсутствуют гены (но она была включена в отчёт по причине большого размера относительно стандартов лаборатории, либо по причине наличия другой CNV, вместе с которой она может иметь большую клиническую значимость, например, сочетание терминальной делеции и дупликации негомологичных хромосом). CNV присутствует у небольшого количества индивидов в общепопуляционных базах данных, но не является распространённым полиморфизмом.

• 
  Слайд 49

  CNVs С НЕИЗВЕСТНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТЬЮ, НЕТ ПОДКЛАССИФИКАЦИИ

  CNV содержит гены, однако неизвестно, чувствительны ли они к изменению числа копий; CNV представлена во многих противоречащих друг другу публикациях и/или базах данных, из-за чего невозможно сделать вывод о ее клинической значимости.

• 
  Слайд 50
  

  НЕОЖИДАННЫЕ КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ, НЕ ОТНОСЯЩИЕСЯ К ПРИЧИНЕ НАПРАВЛЕНИЯ

  Носительство CNVs, связанных с рецессивными заболеваниями Носительство CNVs, связанных с заболеваниями с поздним началом или не диагностированными состояниями Носительство вариантов, ассоциированных с риском неоплазии

• 
  Слайд 51

  НОСИТЕЛЬСТВО CNVs, СВЯЗАННЫХ С РЕЦЕССИВНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

  Обнаружена мутация в гене, связанном с хорошо описанным в литературе рецессивным заболеванием с достаточно высокой частотой встречаемости в популяции, к которой относится пациент, и/или при котором доступны альтернативные методы диагностики (например, муковисцидоз). Обнаружена мутация в гене, связанном с рецессивным заболеванием с симптоматикой, совпадающей с имеющейся у пациента.

• 
  Слайд 52

  НОСИТЕЛЬСТВО CNVs, СВЯЗАННЫХ С ЗАБОЛЕВАНИЯМИ С ПОЗДНИМ НАЧАЛОМ

  Сообщать или нет? Может ли пациент принимать такое решение? Если сообщать, то о каких именно состояниях?

• 
  Слайд 53

  НОСИТЕЛЬСТВО CNVs, СВЯЗАННЫХ С РИСКОМ НЕОПЛАЗИИ

  Сообщать или нет? Какие варианты могут быть включены в отчет?

• 
  Слайд 54

  ИНТЕРПРЕТАЦИЯ ВНЗ

  Вариации с неизвестной клинической значимостью Обследование родителей Родитель не носитель Родитель носитель Здоров Болен Неполная пенетрантность Варьирующая экспрессивность Эффекты импринтинга Мозаицизм у родителя CNV вероятно патогенная или CNV и болезнь наследуются независимо CNV вероятно патогенная

• 
  Слайд 55
  

  Пациентка Р., 3 годаКлинический диагноз: Буллезный эпидермолиз, простая форма в сочетании с костной патологиейОбнаружено большое количество протяженных участков с потерей гетерозиготности(˃3 млн. п.н.) – 5,4%

• 
  Слайд 56
  

  ФЕНОТИП ПАЦИЕНТА Фенотип синдромов попа-дающих в зону потери гетерозиготности = => Анализ мутаций связанных с рецессивными заболеваниями Мутации в области потери гетерозиготности могут быть причиной аутосомно-рецессивных заболеваний

• 
  Слайд 57
  

  Пациентка Р., 3 годаКлинический диагноз: Буллезный эпидермолиз, простая форма в сочетании с костной патологиейОбнаружено большое количество протяженных участков с потерей гетерозиготности(˃3 млн. п.н.) – 5,4%

• 
  Слайд 58

  ЗАПИСЬ РЕЗУЛЬТАТОВ ХРОМОСОМНОГО МИКРОМАТРИЧНОГО АНАЛИЗА

  arr(1-22)x2,(X,Y)x1 – норма, мужской пол arr(1-22,X)x2 – норма, женский пол arr[hg19] 7p21.1p14.1(16817164_40301877)x3 arr – array, указывает на то, каким методом был выполнен анализ [hg19] – версия референсного генома 7p21.1p14.1 – локализация точек разрывов (16817164_40301877) – геномные координаты х3 – число копий в анализируемой области

• 
  Слайд 59
  

  ПОКАЗАНИЯ К ХМА

• 
  Слайд 60

  ХМА В ПОСТНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ

  ХМА является тестом первой линии в постнатальной диагностике причин МВПР с задержкой развития или без нее при отсутствии у пробанда признаков известных хромосомных, моногенных и других синдромов.

• 
  Слайд 61

  РАСПРЕДЕЛЕНИЕ CNVs ПО РАЗМЕРУ(пациенты с МВПР, ЗР, МАР)

  МВПР– множественные врожденные пороки развития ЗР– задержка развития МАР– малые аномалии развития

• 
  Слайд 62

  КЛАССИФИКАЦИЯ CNV В РАЗЛИЧНЫХ ГРУППАХ ПАЦИЕНТОВ

  МВПР – множественные врожденные пороки развития ЗР – задержка развития МАР – малые аномалии развития

• 
  Слайд 63
  

  ЧАСТОТА НЕКОТОРЫХ СИНДРОМОВ В ГРУППЕ ИЗ 3299 ПАЦИЕНТОВ

• 
  Слайд 64

  КАК СДЕЛАТЬ ПРАВИЛЬНЫЙ ВЫБОР?

• 
  Слайд 65
  

  Сбалансированные хромосомные перестройки (транслокации, инверсии) Ожидаем ли мы увидеть сбалансированную перестройку у пробанда с МВПР? Точковые мутации Болезни экспансии тринуклеотидных повторов Микроделеции/микродупликации, размер которых меньше разрешающей способности микроматрицы ОГРАНИЧЕНИЯ МЕТОДА

• 
  Слайд 66
  

  НЕТ! НУЖНО ЛИ ПОДТВЕРЖДАТЬ РЕЗУЛЬТАТЫ ХМА? Система Геноскан 3000 является единственной апробированной полногеномной технологией и оборудованием, которое используется для молекулярно-цитогенетического анализа, сертифицировано и имеет разрешение к применению для диагностических целей.

• 
  Слайд 67
  

  Клинический экзом Тщательное прочтение избранных участков по разумной цене за счет отказа от анализа >99.5% генома. Метод создан для выявления точковых мутаций в кодирующих участках ~4800 генов. Детекция некоторых хромосомных перестроек – побочное применение метода с существенными ограничениями ХМА Метод создан для выявления хромосомной аномалии. Охват практически 100% генома, надежная детекция любых перестроек в тщательно валидированных пределах чувствительности Не выявляет точковые мутации Из генома извлекаются участки экзонов с помощью сложной процедуры Остальные 99.5% участков ДНК отмываются и не анализируются Максимально равномерный анализ 100% хромосомной ДНК Клинический экзом и ХМА: различные задачи и принципы методов

• 
  Слайд 68
  

  Плотность анализируемых участков в клиническом экзоме не соответствует даже самому дешевому варианту ХМА; их распределение крайне неравномерно Клинический экзом – 62 309 отрезков Полный экзом – 214 115отрезков ХМА «Оптима» – 166 468точек ХМА «Стандартный» – 750436точек ХМА «Расширенный» – 2 696 550точек Разрывы до нескольких млн. п. о. с. Вольфа-Хиршхорна (del4p; различные образцы), chr4 п.о.

• 
  Слайд 69
  

  Эффективность выявления CNV в полноэкзомных данных по сравнению с ХМА (сравнение программных алгоритмов) [Parker et al., 2016] Специфичность (доля находок в полном экзоме, подтвердившихся при использовании ХМА) Чувствительность (доля находок ХМА, детектированных и в полном экзоме) Максимальные значения – чувствительность 80.9% / специфичность 57.1% для программы ExomeDepth и 65.4% / 78.4% для CLAMMS. Из анализа исключены все аберрации, не затронувшие хотя бы 1 экзон. Учитывая, что в клиническом секвенировании экзома анализу подвергается в 4 раза меньше генов, полученные величины для КСЭ были бы гораздо меньше. Packer JS, et al. Bioinformatics. 2016 Jan 1;32(1):133-5.

• 
  Слайд 70
  

  Секвенированиеэкзома, хотя уже подтвердило свою высокую эффективность в выявлении точковых мутаций, пока является сравнительно новым методом, где только предстоит выработка национальных рекомендаций. В общепризнанных рекомендациях ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics; Rehm et al., 2013) метод в принципе не рассматривается с точки зрения детекции хромосомных микроперестроек. ХМА, напротив, давно признан «золотым стандартом» молекулярной цитогенетики, как за рубежом, так и в России; в частности, МГНЦ РАМН в 2015 г. опубликовано описание медицинской технологии «Использование хромосомного микроматричного анализа для повышения эффективности медико-генетического консультирования». Это значит, что даже при успешной детекции аберраций с помощью NGS их необходимо обязательно подтверждать референсным методом для постановки диагноза – в случае совсем крупных делеций или дупликаций таковым может послужить кариотип, но в большинстве случаев подтверждающим методом будет выступать ХМА.

• 
  Слайд 71

  ГЕНЕТИЧЕСКОЕ КОНСУЛЬТИРОВАНИЕ ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ХМА

  ПРОБЛЕМЫ Назначения врача не выполняются Завышенные ожидания от результатов анализа Пациенты получают результаты исследования до того, как с ними может ознакомиться врач Нарушение требований к подготовке заключений Незнание или непонимание содержимого заключения

• 
  Слайд 72
  

  ОСОБЕННОСТИ Некоторые патогенные CNV наследуются Могут иметь неполную пенетрантность Выявление CNV с неизвестной клинической значимостью требует проведения дополнительных обследований Выявление патогенных CNV у пробанда – основание для рекомендации пренатальной диагностики Ложное отцовство, ВРТ с донорскими клетками

• 
  Слайд 73
  

  НАСЛЕДСТВЕННЫЕ СИНДРОМЫ И ОСЛОЖНЕНИЯ АНЕСТЕЗИИ (Merlin G. Butleretal. «Specific Genetic Diseases at Risk forSedation/Anesthesia Complications» AnesthAnalg 2000;91:837–55)

• 
  Слайд 74
  

  ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОКАЗАНИЯ Высокий риск ХП по результатам НИПТ Ребенок с хромосомной патологией в семье Носительство сбалансированной хромосомной перестройки у одного из родителей Высокий риск ХП по результатам скрининга УЗ-маркеры ХП ВПР плода ВОЗМОЖНОСТИ Анеуплоидии, триплоидии Микроделеции/микродупликации Несбалансированные транслокации Потеря гетерозиготности, ОРД

• 
  Слайд 75
  

  ХМА в качестве замены анализа кариотипа рекомендован при выявлении пороков развития плода или мертворождении врач должен обсудить преимущества и ограничения анализа кариотипа и ХМА с пациентами, которым показана инвазивная процедура проведение пре- и посттестового консультирования должен проводить врач, имеющий опыт в интерпретации результатов ХМА пациенты должны быть информированы об ограничениях ХМА, а также о возможности выявлять признаки родства родителей при выявлении ВНЗ рекомендована консультация эксперта имеющего доступ к базам данных для выявления генотип-фенотипических корреляций не рекомендуется использование ХМА в качестве теста первой линии для диагностики причин потери беременности в первом триместре

• 
  Слайд 76

  ЭФФЕКТИВНОСТЬ ХМА В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ

  УЗ-аномалии – 6% Другие причины – 1,7% от общего числа случаев с нормальным кариотипом плода УЗ-аномалии – 6,5% Возраст старше 35 лет – 1% Другие причины – 1,1% от общего числа случаев с нормальным кариотипом плода

• 
  Слайд 77
  

  77 АНАЛИЗ CNV В ТКАНИ ОПУХОЛИ ERBB2

• 
  Слайд 78

  АНАЛИЗ КАРИОТИПА, CGH ИЛИ ХМА

• 
  Слайд 79