Презентация на тему "12 дуплетный код"

Содержание

• 
  Слайд 1

  12 ДУПЛЕТНЫЙКОД

  Турнир юных биологов 2007 ФыМыШата

• 
  Слайд 2

  Генетический код – это

  Способ записи информации о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК = «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.

• 
  Слайд 3

  Каким должен быть дуплетный код

  Число возможных дуплетов = 16 Им можно закодировать не более 15 а.к. один из дуплетов – на СТОП-кодон

• 
  Слайд 4

  Наш метод создания кода:

  Выбрали белки лизоцим(129 а.к.) и миоглобин(154 а.к.); Разделили а.к. на две группы: а) обязательно кодируемые б) с похожими радикалами Посмотрели, какие а.к. наиболее часто встречаются в данных белках; Подобрали дуплеты и а.к. так, чтобы коэффициент q был как можно больше.

• 
  Слайд 5

  Проблема глицина:

  считать глицин полярной или неполярной а.к.? Мы считали неполярной, потому что: Gly – п: qтр=1,16 Gly – н/п: qтр=1,28

• 
  Слайд 6
  
• 
  Слайд 7
  

  Знаком начала гена мы выбрали СТАРТ-кодон АУ кодирует Мет, а в начале гена фМет. (в триплетном АУГ) Знак окончания гена – СТОП-кодонУА (в триплетном УАА, УАГ, УГА)

• 
  Слайд 8

  Идеальный дуплетный код

• 
  Слайд 9

  Свойства дуплетного кода:

  Отсутствие межкодонных знаков препинания Наличие межгенных знаков препинания Однозначность Неперекрываемость Дуплетность Нет вырожденности (избыточности) Экономичность (на белок той же длины нужно меньше ДНК)

• 
  Слайд 10
  

  Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетный

  Один из самых важных параметров - помехоустойчивость

• 
  Слайд 11

  Помехоустойчивость

  X Y 12 Консервативная замена – не меняет класс аминокислоты Радикальная замена – меняет класс аминокислоты

• 
  Слайд 12

  Классификация аминокислот по полярности радикала

  Гидрофобные (неполярные) Гидрофильные Полярные Заряженные (ионы) + ─

• 
  Слайд 13

  Подсчёт коэффициентапомехоустойчивости (q).

  Число радикальных замен = 40, А консервативных - 44, Учитывая, что глицин – неполярная аминокислота и не включая кодон УА q=44/40 = 1,1.

• 
  Слайд 14

  Недостатки дуплетного кода:

  Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот. Возможный путь преодоления: Посттрансляционная модификация

• 
  Слайд 15
  

  Molecular Cell BiologyHarvey Lodish et al. Примеры пострансляционной модификации аминокислот

• 
  Слайд 16

  Недостатки дуплетного кода:

  Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп1,1) Нет вырожденности (избыточности).

• 
  Слайд 17

  Литература

  В.А. Ратнер. Молекулярно-генетические системы управления. Наука, Новосибирск, 1981.